메이지9년、우에스기 켄신、우에스기 요잔을 제신(신사에 모신 신)으로서、요네자와 성 중심 터에 건립。
메이지35년에 別格官幣社(벳카쿠칸페이샤=메이지 정부가 정한 신사의 신으로 정함、분류를 표시。국가에 힘쓴 인물을 모신 신사)로 지정되어、이때 제신(신사에 모신 신)은 켄신만 인정 되고、요잔은 섭사에 모시어 마쓰가사키 진자 신사가 됩니다。
다이쇼8년에 일어난 요네자와 대화재에서 불길이 옮겨져、대부분의 건물이 타버렸지만、그 후 나라에서 원조금이나 요네자와 시민의 노동 봉사 등에 의해、다이쇼12년、현재의 신사가 완성。
설계는 요네자와 출신으로、신사 건축의 일인자 이토 츄타 박사。
우에스기 진자 신사는 지금도 요네자와 시민의 마음의 버팀목이 되어서、새해 첫 참배나 오미야 마이리(아기、 건강、 장수를 바라는 신사 참배)、결혼식이나 안전기원 등、사계절을 불문하고 많은 시민이 방문하고 있습니다。
경내에 우에스기씨 인연의 문화재를 다수 수장하는 케쇼덴 보물관이、근처의 요네자와시 우에스기 박물관이 있습니다。 예제(정해진 축일)4월29일。요네자와 우에스기 마쓰리 축제・우에스기 눈 등롱 마쓰리 축제의 회장。벚꽃의 명소。